Karl Lindahlin suunnittelema alkuperäinen Varkauden saha paloi vuonna 1944. Arkkitehti Alvar Aalto laati modernin uudisrakennussuunnitelman vuosina 1944-1945 ja saha valmistui vuonna 1948.

Aalto hyödynsi suunnitelmansa pohjana entisen sahan pystyynjääneitä tiiliseiniä. Lindahlin sahan ulkoseiniä hallinnut ornamentiikka väistyi Aallon suunnitelmassa puhtaiden tiilipintojen tieltä, ja mielenkiintoisena erityispiirteenä Aalto suunnitteli sahan pohjoisenpuoleiseen päätyyn hakkeensäilytystornin, jota verhosi aaltoileva panelointi. Aaltoileva puuverhous esiintyi jo Aallon suunnittelemissa Lapuan metsäpaviljongissa (1938) ja New Yorkin näyttelypaviljongissa (1939). Aalto suunnitteli sahan yhteyteen myös sähköosaston ja varaston vuosina 1942-1945, mutta niitä ei koskaan rakennettu ja niiden piirrokset ovat kadonneet.

Saha purettiin vuonna 1975, kun uusi saha valmistui Ahlströminkadun toiselle puolelle.

Alvar Aallon suunnitteleman Varkauden tehtaiden sahan rakentaminen entisen, vuonna 1944 palaneen sahan paikalle. Uudisrakennus valmistui vuonna 1948.