Tutkimuksen tausta ja tavoitteet: Eturauhassyöpä on miesten yleisin syöpä Suomessa. Eturauhassyövän molekulaariset mekanismit ovat vielä epäselviä ja vain muutama todellinen kohdegeeni on löydetty. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli tunnistaa geeni(t), jonka monistunut kopioluku nostaa sen ilmentymistasoa, sekä määrittää 9p13.3 monistuman yleisyys ja kliinis-patologisten muuttujien assosiaatiot kliinisissä eturauhassyöpänäytteissä.

Tutkimusmenetelmät: Tutkimuksessa käytettiin 7 eturauhassyöpäsolulinjaa ja 19 eturauhassyöpävierassiirrännäistä. Suhteelliset lähetti-RNA -tasot määritettiin kvantitatiivisella käänteiskopiointipolymeraasiketjureaktiolla ja kopiolukumuutokset fluoresenssi in situ hybridisaatio (FISH) -tekniikalla. Lisäksi 143 prostatektomianäytettä ja 70 hormoniresistenttiä kasvainta analysoitiin FISH-menetelmällä.

Tutkimustulokset: Vierassiirrännäisen LuCaP35 avulla 9p13.3 monistuma rajattiin BAC-kloonien RP11-156G14 ja RP11-115O15 väliin. PIGO geenillä esiintyi merkittävää ja UNC13B geenillä melkein merkittävää assosiaatiota kopioluvun ja ilmentymistason välillä. Osa geeneistä osoitti kuvaajissa hyvää korrelaatiota, heikoista p-arvoista huolimatta. Prostatektomianäytteistä 10 % sisälsi korkean ja 32 % matalan kopioluvun monistuman, kun taas hormonirefraktorisista näytteistä 14 % sisälsi korkean ja 44 % matalan kopioluvun monistuman. Prostatektomia leikatuilla potilailla 9p13.3 monistumalla oli merkittävää assosiaatiota korkeampiin PSA tasoihin. Lisäksi, eloonjäämisanalyysi osoitti assosiaatiota 9p13.3 monistuman ja prostatektomia leikattujen potilaiden huonon progressiovapaan eloonjäämisen välillä.

Johtopäätöset: Lupaavimmat kohdegeeniehdokkaat 9p13.3-monistumalle ovat PIGO ja UNC13B, mutta myöskään CD72, VCP, GALT, DCTN3, C9orf25, UBAP2, RUSC2 ja UBE2R2 ei voida pois sulkea. Kliinisissä eturauhassyöpänäytteissä 9p13.3-monistuma oli hieman yleisempi hormonirefraktorisissa kuin hoitamattomissa eturauhassyövissä. Molemmissa havaittiin korkean kopioluvun monistumia, osoittaen että 9p13.3 monistuma on suhteellisen aikainen tapahtuma taudin etenemisessä, mutta saattaa liittyä myös aggressiivisiin eturauhassyöpä tapauksiin.